Rektorati është organ kolegjial ekzekutiv i Universitetit POLIS i cili përbëhet nga:

1. Rektori;
2. Zëvendës-Rektori;
3. Drejtuesit e njësive kryesore;
4. Administratori i Shpk –së;
5. Administratori i IAL-së;

Rektorati kryhesohet nga Rektori dhe ushtron disa funksione kryesore si:
a) harton planin strategjik të zhvillimit të institucionit, mbështetur në propozimet e njësive bazë dhe kryesore të Universitetit POLIS.
b) zbaton të gjitha vendimet e Senatit Akademik dhe të Bordit të Administrimit.
c) harton planin vjetor të punës, në nivel institucional, në përputhje me planin strategjik të zhvillimit të institucionit dhe ndjek zbatimin e tij pas miratimit nga Senati Akademik.
d) shqyrton rezultatet e raporteve të vlerësimit vjetor të cilësisë.
e) monitoron dhe publikon rezultatet e vlerësimit të veprimtarive të Universitetit POLIS. f) harton raportin vjetor të veprimtarisë mësimore-kërkimore etj.